不得不承认，PET-CT存在一定的辐射，因为任何一种电器用品都或多或少存在辐射，例如生活中常见的手机。PET-CT的辐射主要来自于示踪剂18F-FDG，18F-FDG是指氟代脱氧葡萄糖，葡萄糖是人体三大能源物质之一，可以被PET探测并形成影像的正电子核素18F所标记，即18F-FDG。因为18F-FDG可以准确的反映体内器官与组织的葡萄糖代谢水平，是目前PET-CT显像的主要显像剂。
然而PET-CT示踪剂的半衰期仅有2小时，也就是检查后2小时，体内就有一半示踪剂已经被代谢掉，短时间内显像剂的放射性对人体是没有太大的影响的，而且会很快代谢并随人体的尿液排出。因此PET-CT检查的辐射很小，在检查后几个小时内，受检者身上的仅有微量的辐射含量，而且检查后医生都会建议多喝水，这样可以加快显像剂的排出。但是检查后16小时内尽可能的不要接触孕妇和小孩子。因此可以说PET-CT检查的副作用很小，几乎可以忽略不计。
PET-CT扫描一次接收到的辐射量大约是10mSv左右。其中CT剂量1.3-4.5mSv，药物剂量是根据体重计算，每公斤需0.1-0.15mCi，80公斤重的人注入10mCi，辐射量是7mSv。如果需要加一次局部的延时现象，则为12-13mSv左右。
按照国际辐射防护委员会要求，从事放射职业人员照射限量为每年每人50mSv以下，那我们普通的病人每年做一次PET-CT是十分安全的，根据病情需要需做2-3次也是安全范围。
