肝癌对放射治疗不甚敏感，且在采用杀伤肝癌细胞的剂量照射肝脏组织时，正常的肝细胞也受到相当的杀伤。但由于定位方法的改进，技术上采用局部或半肝移动照射，疗效可显著提高。目前趋向于用放射治疗合并肝动脉栓塞化疗，再同时结合中药或其他治疗方法，治疗效果更好。质子治疗打破了肝癌放疗耐受的局面，我们将质子治疗成为首 选放疗。
质子治疗优于普通放疗首先是照射线不同，普通放疗是X射线，属于光子线，副作用较大，周围健康组织易受到损害；质子采用的是质子线，对人体辐射伤害小。其次，质子线照射肿瘤时会形成一个布拉格峰，简单来说就是射线的能量在到达肿瘤部位后全部释放出来，肿瘤前、后以及周边健康组织不受波及；X射线到达人体皮肤开始就释放能量，皮炎是最常见的副作用，到达肿瘤部位能量消耗大半，有效剂量不足，且肿瘤后面还会有能量射出，健康组织无法避免受到损害。质子治疗时间较短，几分钟就可以完成治疗，一般门诊治疗后，就可以回家。
质子治疗的优势是，同样的治疗效果，质子治疗不会引发严重的副作用，例如肝脏周边有重要的器官，肺、心脏、食管、脊柱等，X线放疗不敢保证这些器官受到损伤的程度，有可能发生严重的并发症而导致死亡。
