约翰·霍普金斯大学医学院的一项新的原理验证研究已成功地使用了下一代DNA测序来诊断或排除可疑的脑部感染。
这项发表在《神经学》杂志上的研究表明，使用计算机快速分析大量遗传和生物学信息可能是具有成本效益的诊断工具的新面貌。
“通过将现代基因测序技术整合到病理学诊断中，我们能够调查10位受试者的潜在感染情况，并在本研究检查的10例患者中有8例发现了对临床问题的适当解释，” Carlos Pardo-Villamizar说，约翰霍普金斯大学医学院神经病学副教授医学博士在一份声明中。
在这项研究中，研究人员在约翰霍普金斯医院招募了10名患者，这些患者具有脑部感染的临床体征和神经系统症状的快速发作，包括四肢无力，部分瘫痪麻木，头痛或癫痫发作。
研究人员对每位患者的脑部病变进行了活检。然后，他们使用可商购的遗传测序技术对已获取的脑组织的DNA进行测序，该技术可以同时读取数百万个DNA片段。
利用包含2817个细菌基因组，4383个病毒基因组和26个单细胞病原体基因组的人类和非人类DNA序列数据库，研究人员减去了人类DNA的结果，并对样本中发现的其他前三个物种进行了排名成为潜在的传染性生物。
通过这种方法，研究人员成功地确定了三个参与者的感染原因。另一方面，该方法未指出五名参与者中引起感染的病原体。相反，阴性结果帮助临床医生对患者所经历的疾病有了更好的了解。
然而，用于脑部感染的新诊断方法具有一个主要缺点。它仅取决于病原体的可用遗传序列。这意味着需要更多的研究来建立在正常，健康的大脑中可以发现哪些生物的基线。还需要扩展当前的人类和非人类DNA序列数据库。
