质子治疗的时候疼吗？大多数患者在治疗时没有任何感觉，有些患者治疗后有皮肤红、脱皮等阳光下的皮肤反应，其他患者肿瘤附近的正常组织接受少量放射线可能会出现副作用，如口腔问题或吞咽困难等，但这些副作用与传统放射线治疗相比相当轻。
每次质子治疗时间约为30分钟左右，实际上单纯照射的时间不长，可能不到5分钟。比较耗时的是照射前的定位，对光子放射治疗质子精度的要求更高。另外，大部分患者都是门诊治疗，治疗结束后回家，应该吃喝，不需要住院。
与光子放射治疗相比质子放射治疗的重要特性是存在布拉格峰，布拉格峰带来的实际运用是所谓的“定向爆破”，质子和重离子的大部分能量集中在肿瘤的位置，对周边正常组织的损伤小。
胃癌、直肠癌可以使用质子治疗吗？空洞脏器肿瘤一般不进行质子放疗，特别是对于无远处转移的中早期患者，传统手术和术后或术前辅助化疗通常会取得更好的效果。
另外胃肠本身有蠕动特性(拿着听诊器听肚子的话，通常每分钟能听到4~5次咕噜咕噜的声音。这是肠道蠕动时的声音)，这个特性对照射精度非常要求的质子治疗很费工夫，所以大部分情况下，质子治疗不用于胃肠肿瘤。
