元基因组数据库检测噬菌体衍生的抗菌酶
科学家证明，来自世界上第一个元基因组分析的有关宿主细菌-噬菌体（噬菌体）关联的信息可用于开发针对肠道病原体的噬菌体疗法。
在发表于《细胞宿主与微生物》（Cell Host＆Microbe）上的一项开创性研究中，大阪市立大学和东京大学医学研究所的研究人员报告了101名健康日本人粪便的粪便样本中的肠道细菌和病毒基因组信息。该分析利用宿主细菌-噬菌体的关联，检测到了可控制病菌的噬菌体衍生的抗菌酶。作为概念验证，噬菌体来源的溶血素被证明可调节小鼠艰难梭菌感染。
让我们对那些艰难的梭状芽胞杆菌进行特殊的“噬菌体”攻击吧！
人类肠道菌群异常（称为营养不良）与各种疾病有关。改变的微生物生存能力削弱了宿主肠道菌群的有益作用，导致某些共生共生细菌获得毒力特征，繁殖并直接参与疾病的发展。这些细菌被称为“致病菌”，与机会性病原体不同。
难辨梭状芽胞杆菌是革兰氏阳性，可形成孢子的厌氧菌，是病原菌，是抗生素治疗后医院腹泻的代表性病因。由于抗生素的使用具有杀死有益细菌和促进营养不良的风险，因此开发专门操作肠道病原体的方法至关重要。
上松聪教授相信：“噬菌体肯定可作为消除肠道病原体的高度特异性疗法”。噬菌体与人肠细菌之间的传染性关联是开发噬菌体疗法必不可少的信息。研究人员通过建立病毒分析管道，从101名健康个体的粪便样本中获得了有关细菌-噬菌体相关的元基因组信息，这至今尚未被人们理解，被称为“病毒暗物质”。根据这些信息，研究人员筛选了C。艰难梭菌特异性噬菌体，并在体外和体内鉴定出新颖的抗菌酶。
“有关肠道噬菌体和细菌的更多宏基因组学信息的积累，将为开发治疗多种与营养不良相关的疾病提供了可能性，”藤本浩介博士和濑本诚夫教授说。
参考：藤本浩介，木村康正，下东正树，佐藤武史，佐藤慎太郎，佐佐木浩二，上松美穗，川口裕之助，臼中中香，吉井幸夫林，鹿岛康司，吉田由纪，山口清，古河阳一，角田正则，秋山丰，山口瑞，Sheila E.Crowe，彼得·B·恩斯特，宫田聪，清野浩史，井本聪和植松中，2020年7月，细胞宿主＆Microbe.DOI：
10.1016 / j.chom.2020.06.005
