所有患者都可以做质子治疗吗？并非所有癌症都适合质子治疗，同时它也不能取代化疗、靶向治疗或大部份的手术治疗，咨询质子治疗的患者必须先见肿瘤放疗科医生。具体能不能做质子治疗，需要由专科医生和患者共同商议决定，简单来说，以下情况通常是不能或者不建议做质子治疗的：
全身广泛转移：这时候应当是全身系统治疗为主，质子治疗的帮助很有限；病理类型不明：例如还没有做过病理活检的患者；血液肿瘤：例如白血病和多发性骨髓瘤等；空腔脏器肿瘤：例如胃癌和结直肠。
如前所述，空腔脏器的肿瘤一般是不会做质子放疗的，尤其是对于没有远处转移的中早期患者，通常来说传统的手术加上术后或者术前的辅助化疗会获得更好的效果。另外胃肠道本身具有蠕动特性（你拿个听诊器听听肚子，正常情况下每分钟能听到4-5次咕噜声，这就是肠道蠕动时发出的声音），这一特性对于照射精度要求非常高的质子治疗来说很棘手，所以大多数情况下，质子治疗是不用于胃肠道肿瘤的。
什么类型的肿瘤适合质子治疗？总体来说，儿童肿瘤从质子治疗中获益非常大，因为质子治疗对儿童仍在成长的器官影响较小。对于儿童患者的质子治疗，必须要有放疗科医生、肿瘤内科医生和儿科医生的共同评估。儿童治疗和成人治疗是存在较大差别的，所谓的“成人一片儿童减半”并不正确，很多药物、疗法可能直接是儿童慎用或禁用的，比如常用的抗生素氧氟沙星，因为可能会影响到软骨发育，被禁止使用于18周岁以下儿童。此外，由于需要全程保持固定姿势，一些年纪过小的孩子在接受质子放疗的时候可能需要使用镇静剂。
