在临床上，PET-CT检查主要用于肿瘤良、恶性的鉴别，临床高度怀疑肿瘤时，PET-CT还可准确提供活检部位，以便及时确诊。PETCT可以提高食道癌患者放疗的精 确度。
PET-CT还可为确诊的癌症病人检查恶性肿瘤有无转移病灶，寻找肿瘤原发灶，对恶性肿瘤进行分期、分级，以协助医生指定最 佳的治疗方案;在肿瘤放射治疗前进行精 确的生物靶区定位。PETCT可以提高食道癌患者放疗的精 确度。
如果利用PET-CT一体及系统，通过其功能影像与解剖影像紧密结合的突出优势则成为了放疗模拟定位的新平台。这是由于CT影像虽然可以清楚显示解剖特征，但难以确定浸润性肿瘤的边缘，并难以区分肿瘤的局部浸润与炎症反应，如果结合PET影像则可反应肿瘤及正常组织的机能、血流量、分子的新陈代谢信息。
PET-CT同机融合图像使解剖学影像和功能性影像有机结合达到了更高的层次，进一步提高了食管癌靶区勾画的精度，从而在放疗时给药肿瘤高剂量照射的同时最 大限度的保护周围正常组织器官。
