PETCT在头颈部肿瘤中的应用，PETCT主要用于颅内肿瘤的定性、肿瘤的生物学特性、复发和瘢痕的鉴别和疗效评价。根据18F-FDG的浓重程度可以鉴别星形胶质瘤的良恶性。大量临床资料证明PETCT影像是鉴别复发和治疗后瘢痕的最有效手段，可以评价连续动态观察效果。
颅内恶性淋巴瘤:18F-FDG摄取率高，高代谢病灶治疗后18F-FDG摄取率降低，可早期评价疗效，监测复发。同样，脑转移瘤也是恶性肿瘤，具有较强的18F-FDG聚集能力，表现为高代谢病灶。病灶内如有出血、坏死、液化和囊性变化，相应部位可表现为放射性缺损。
PETCT在头颈部肿瘤中的应用，对PETCT在鼻咽癌、喉癌和甲状腺髓样癌、晚期分化癌等头颈部原发癌中有肯定的诊断价值。也可用于视网膜母细胞瘤、上颌窦癌、舌癌等头颈部恶性肿瘤的诊断和转移灶的探索、疗效评价、复发的监测。另外，18F-FDGPETCT检查还可以通过检测剩馀肿瘤，再次监测放射治疗和化疗的疗效，区分没有治疗反应的病例，早期切换到其他治疗方法。
PETCT检查选择医院的规模需要与三级甲等医院或者三级甲等医院的规模和水平相当的医疗机构。PETCT应用相关学科具有高水平的教学科研能力。经济运行状况良好，财政资金或自己资金有保障。非营利医疗机构不得以合作、贷款等融资形式购买。设立独立的核医学科，成立时间在5年以上，具有较高的核医学诊疗水平。
此外，PETCT检查主要依靠PETCT先进的检测设备，PETCT设备越先进进行检测越准确、速度快、分辨率高。技术高超的PETCT专家认为，读取者的技术水平也不能忽视，PETCT检查结果的准确性。PETCT专家的读影水平直接关系到检查结果是否正确，被检查者取得的信息是否正确。
