质子和重离子治疗对人体组织有损伤吗？有。但是质子和重离子技术对健康组织伤害小，这个对比主要是针对传统的放疗。比如常听到的电子线，伽玛刀等。
质子治疗是放射线治疗的一种。质子进入人体后，在射程终点处形成一个尖锐的剂量峰，称为Bragg峰。通过调制能量展宽Bragg峰可以使Bragg峰覆盖肿瘤。另外，质子入射通道上能量损失较小，侧散射也很小，其前后左右正常组织所受剂量较小，故具有较好的放射物理学性能。
简单直接的说就是质子和重离子的物理特性——布拉格峰的出现可以将大部分辐射剂量释放在肿瘤部位，达到更好的治疗效果；同时前（射入）后（射出）的辐射剂量都很低。这是一种简单的比喻，实际上在运行时会复杂很多。比如说质子在简单磁场中的运用，扫描治疗头的蒙特卡罗模型等。
传统放疗为了减少对健康组织的伤害也有独到的办法，比如使用三维适形以及调强方式。在很多成人实体瘤治疗中，采用这些方法同样可以达到质子治疗的效果，而且费用更低。
相比而言，目前质子放疗的优势更加集中在儿童肿瘤患者以及少部分特定肿瘤患者中，个人觉得这些患者包括部分左侧乳腺癌患者、需要进行二次放疗的患者、以及部分追求治疗品质的患者。
质子和重离子技术对人体组织有损伤吗？基于实际情况看，目前绝大部分肿瘤患者并不需要采用质子治疗。除非未来随着技术进步，治疗价格能降低到现有放疗（或者相同）的水平。
