并非所有癌症都适合质子治疗，同时它也不能取代化疗、靶向治疗或大部份的手术治疗。按照美国梅奥诊所的建议，希望咨询质子治疗的患者必须先见肿瘤放疗科医生。具体能不能做质子治疗，需要由专科医生和患者共同商议决定，简单来说，以下情况通常是不能或者不建议做质子治疗的：
全身广泛转移——这时候应当是全身系统治疗为主，质子治疗的帮助很有限；
病理类型不明——例如还没有做过病理活检的患者；
血液肿瘤——例如白血病和多发性骨髓瘤等；
空腔脏器肿瘤——例如胃癌和结直肠，这个问题咱们后面会说。
什么类型的肿瘤适合质子治疗？
在这里再引用一下梅奥诊所的原话：总体来说，儿童肿瘤从质子治疗中获益大，因为质子治疗对儿童仍在成长的器官影响较小。
对于儿童患者的质子治疗，必须要有放疗科医生、肿瘤内科医生和儿科医生的共同评估。儿童治疗和成人治疗是存在较大差别的，所谓的“成人一片儿童减半”并不正确，很多药物、疗法可能直接是儿童慎用或禁用的，比如常用的抗生素氧氟沙星（喹诺酮），因为可能会影响到软骨发育，被禁止使用于18周岁以下儿童。
此外，由于需要全程保持固定姿势，一些年纪过小的孩子在接受质子放疗的时候可能需要使用镇静剂。
和传统放疗相比，质子治疗有更高的治愈率吗？
不一定，从目前的研究情况来看光子放疗的治愈率（或者讲五年生存率）和质子治疗总体相当。但从理论上说，基于质子本身的特性，质子治疗的副作用更小。
关于质子治疗，美国许多肿瘤的NCCN诊疗指南上均有提及。这边随便举几个：
中枢神经系统肿瘤：在可行的情况下，将质子用于头颅放疗是合理的，因为它的毒性更小。
头颈部肿瘤：（筛窦、上颌窦肿瘤）如果光子治疗不能满足正常组织限制时，可以考虑质子治疗。一项系统研究和非比较性的荟萃分析结果显示，接受质子治疗的鼻腔和鼻窦恶性肿瘤患者比接受光子治疗的患者会有更好的疗效。
