对于肝海绵状血管瘤、肝囊肿、肝硬化、肝腺瘤、肝炎、肝脂肪浸润等肝内大多数良性病变一般不会出现18F-FDG高摄取，18F-FDGPET显像对原发性肝癌诊断的特异性较高。所以，对于18F-FDG，petct显像阳性者，基本上可诊断为肝癌，petct显像可以在不做穿刺手术的情况下确诊肝癌，可用于评价肝癌介入、适形放疗、射频消融术的疗效，对治疗后肿瘤残余和复发的诊断明显优于CT。
目前petct检查所用的代谢物及标记物是氟代脱氧葡萄糖（18F-FDG），18F-FDG能被组织细胞摄取，并在己糖激酶的作用下磷酸化，由于18F-FDG不能参加葡萄糖的下一步代谢而停留在组织细胞内，表现为高浓聚而被仪器检查。而肿瘤细胞膜上的葡萄糖转运体高表达，胞内己糖激酶表达及活性明显增强,故表现为18F-FDG在瘤组织内的高浓聚，PET检查表现为标准摄取值明显升高。
对于肝内良性占位性病变，petct特异性可高达90％。虽然个别肝脓肿可出现18F-FDG摄入而引起假阳性，但绝大部分肝内良性病变（如血管瘤、肝腺瘤、肝炎、肝脂肪浸润、局灶性结节状增生及绝大部分肝炎性假瘤等）一般不会出现18F-FDG高摄取；对于转移性肝癌或者原发性肝癌的转移灶petct诊断效果良好。在转移性肝癌中，对18-FDG常有高摄取，petct对转移性肝癌的显像阳性率在90％以上。所以对于原发性肝癌的诊断增强CT或MRI要优于petct。
