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检测病毒的新方法以人类基因组为关键

2020-03-09 14:03:50来源:

分析血清基因组序列的新技术为医生提供了筛查患者病毒的潜力,即使没有将特定的病毒确定为病原体的来源。

利用人类基因组的完整解密,圣路易斯大学的研究人员部署了被称为“转录组减法”的下一代测序(NGS)方法,该方法实质上是一种通过消除过程分离遗传信息的方法。

该大学报告说,研究人员成功的关键在于发现如何扩增血液中的遗传物质。过去,由于RNA降解速度过快,因此无法充分利用血清的潜力。但是扩增过程导致了基因检测的新突破。

圣路易斯大学内科系主任阿德里安·迪·比塞格利(Adrian Di Bisceglie)博士在一份新闻稿中说:“我们发现了一种可以检测新病毒的技术。”

“我们分离出DNA和RNA,扩增血液中存在的遗传物质的数量,进行超深度测序,并使用一种算法来寻找与人类和微生物有关的每个已知遗传密码的匹配。一旦我们删除了已知部分,我们最终将剩下新病毒。

当必须诊断患有特定疾病的患者时,医生可以通过从患者那里获取组织或血液样本并在实验室中进行培养来寻找病毒的存在。但是,只有在有合理的起点寻找该病毒的情况下,该技术才有效。如果采样病毒不是一个好的选择,那么医生可以使用NGS作为检测病毒的一种方法。

通过将人类遗传物质与病毒物质分离,研究人员已经开发出一种将病毒物质与已知病毒数据库进行比较的方法。减去后剩下的任何不能归因于已知病毒的物质都将通过第二项测试,以区分细菌,噬菌体,病毒和其他物质。研究人员发现,在进行第二次减法运算后,他们经常会留下以前已知病毒的遗传标记。

Di Bisceglie说,这种隔离技术将有助于人们了解许多存在于人体中的病毒。

“就像人类微生物组计划正在记录每个人生存和共存的细菌一样,我们也在研究人类病毒,以更多地了解我们所有人体内的病毒。我们认为,并非所有人都有害,有些甚至可能是有益的。”

Di Bisceglie及其同事的研究发表在《生化与生物物理研究通讯》杂志上。

据报道,圣路易斯大学已经为新的检测技术寻求专利保护,并计划积极追求该产品的商业化。