目前患者一次PET/CT检查所接受的辐射剂量已经比较低，对人体健康不会带来不良影响。PET/MR的检查剂量更低，更安全。这是因为：1)PET/MR的PET灵敏度比较高;2)MR相比CT没有辐射;3)更关键的一点，PET/MR扫描是PET等MR，当MR和PET同时扫描时，PET可以相对延长扫描时间来进一步提高信噪比，从而可以降低PET药物注射剂量。
德国爱尔兰根大学学者基于NEMA图像标准，研究发现相比PET/CT(常规每床位2分钟)，PET/MR只需使用一半的药量(PET每床位扫描4分钟)即可获得同等的PET图像质量(Oehmigen，JNuclMed2014)。
每2分钟扫描时间的叠加，T1(PET4分钟扫描)相比T0(PET2分钟扫描)，只需使用一半的药量即可获得同等的PET图像质量。
瑞士苏黎世大学学者同样也发现类似研究结果，进行了很优等NECR、相似靶NECR条件下很优等采集活度比较，相比PET/CT，实际应用发现带Tof的PET/MR(PET每床位采集4分钟)，降低了56%的注射剂量(Queiroz，PlosOne，2015)。
华盛顿大学学者研究发现6名孕妇中每2人分别行PET、PET/CT、PET/MR检查，胎儿辐射剂量为6.29E-03--2.46E-02mGy/MBq，剂量都是低于正常人整个孕期辐射的阈值，而PET/MR*安全，这也是由于MR没有辐射，而且高清解剖有利于胎儿数据测定。
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