在很多恶性肿瘤中有较高的FDG摄取，但也可见于感染、炎症、肉芽肿、增生以及一些良性肿瘤中，同时还有FDG的生理性摄取，使得PET显像诊断尤为困难。应用PET-CT能够显示病灶与周围组织结构的关系，对FDG异常浓聚部位进行准确定位，提高了对病变性质和病变部位诊断的准确性。
PET-CT检查可以对乳腺癌的远处转移与局部复发进行评估。PET可准确地显示出未被CT和MRI发现的局部复发、骨转移、淋巴结转移等；18-FDG对全身转移灶的检出优于CT、MRI；对溶骨性转移灶，18-FDG优于99mTc-MDP骨扫描，乳腺癌病人极容易发生肺部及骨髂转移，而PET-CT中诊断性CT可以发现小于2mm的肺部小结节灶。
PET-CT检查对监测乳腺癌治疗效果有什么作用呢？早期了解肿瘤组织经化学和放射治疗变化，对及时调整治疗方案，减少并发症和降低那些无效治疗的费用等是非常必要的。PET-CT另一个重要角色是治疗监测和评估，肿瘤FDG摄入量反应出肿瘤细胞的数量和肿瘤细胞的糖代谢率。
PET-CT不仅确定肿瘤性质，而且能定量的评估肿瘤代谢活度，对于预测肿瘤的生物行为和预测肿瘤对化疗或内分泌治疗的生物活性反应都极具重要意义。一些研究显示，做为有效治疗的响应，在传统的形态影像学可以显示肿瘤大小变化之前，PET-CT可以探测到瘤灶的低代谢。PET-CT是早期预测乳腺癌化疗疗效的灵敏方法。
