该基金是各国代表团之间争执的重点。宣言草案要求同时为艾滋病毒预防和艾滋病治疗提供资金-包括新的联合疗法，目前仅适用于有能力为其付费的人。
皮奥特告诉WebMD，“承诺宣言，我们希望将由联合国承保，实际上表明预防和关怀具有内在联系。”
并非所有国家都同意可以为需要的每个人提供最先进的治疗。美国-在其正式的会议代表团中任命了一家大型制药公司的首席执行官为代表-不愿意加入普遍获得艾滋病药物的呼吁。
国务卿鲍威尔在会议上的致辞中承诺，美国将继续是抗击艾滋病的最大捐助国。但是，他强调，预防是控制这一流行病的关键。
甚至预防也一直是一个有争议的话题，一些国家质疑文件草案中的用语，专门针对与男性发生性关系的男性，商业性工作者以及静脉吸毒者提供服务。同样有争议的是支持妇女保护自己免受艾滋病毒传播的权利的语言，并呼吁广泛分发安全套。
安南在开幕式上的激动人心的讲话中说：“让我们记住，无论出于何种原因，每个被感染的人都是具有人权和人类需要的同胞。”“没有人想到我们可以通过在我们与他们之间建立障碍来保护自己。因为在无情的艾滋病世界中，没有我们和他们。”
