两个独立的研究小组发表了人类蛋白质组图谱的初稿。一项研究是印度和美国研究人员的联合合作,而另一项研究是德国研究人员的。
两个团队都使用先进的设备从人体组织中收集蛋白质,并绘制出人类蛋白质组的全面图谱-人类基因组的蛋白质等同物。这项第一项研究是由约翰霍普金斯大学生物信息学研究所和其他地方的研究人员绘制的,它对由17,924个基因编码的蛋白质进行了定位,约占所有注释基因的84%。德国研究小组对人体19629种蛋白质中的约92%进行了分类。
此外,两个团队都发现了由基因编码的蛋白质,这些基因先前被称为“垃圾”或无功能的DNA。研究表明,尽管对基因数据进行了很长时间的分类,科学家们仍不确定几个基因的功能。印度团队发现了至少200种新型人类蛋白质。研究人员称它们为“缺失蛋白”。
新的数据库类似于人类基因组计划,该计划于2003年完成。蛋白质图谱仍然不完整,但填补了蛋白质研究的主要空白。
这些团队对蛋白质数据库感到兴奋。
班加罗尔生物信息学研究所的Harsha Gowda博士对《自然世界新闻》说:“令人惊讶的偶然发现是,我们两个小组同时在研究[蛋白质组图草案]时彼此都不了解。”“比较我们的数据集以扩展我们对人类蛋白质组的理解将很有趣。”
“我认为Pandey论文是一项伟大的工作,两项研究都极大地增进了我们对人类蛋白质组和基因组的理解,”慕尼黑工业大学的BernhardKüster的研究主要作者Bernhard Kuster说,他对《自然世界》新闻。库斯特指的是约翰·霍普金斯大学的Akhilesh Pandey,后者由印度班加罗尔的研究人员研究了蛋白质图谱。
两个团队使用略有不同的方法来创建人类蛋白质组图。印度研究人员表示,他们必须从30个人体组织样本中去除蛋白质来“从头开始”。然后,他们使用质谱法找到每种蛋白质的相对丰度。研究小组仅使用正常蛋白质进行研究。他们所有的数据都是在一个平台上开发的。
Pandey说,他的实验室产生的数据“将成为该领域的黄金标准”,因为这些数据是使用统一的方法和分析得出的。
德国研究人员从公共数据库收集了数据,并将其与实验室生成的数据结合在一起。
这两个团队的数据都可以在线获得;可以在此处找到人类蛋白质组图,在此处可以找到蛋白质组学数据库。两项研究均发表在《自然》杂志上。